Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot9Q9JKY0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnot9Q9JKY0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnot9Q9JKY0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnot9Q9JKY0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms