Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stx6Q9JKK1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx6Q9JKK1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx6Q9JKK1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx6Q9JKK1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms