Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mrpl39Q9JKF7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mrpl39Q9JKF7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mrpl39Q9JKF7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms