Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trem1Q9JKE2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trem1Q9JKE2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trem1Q9JKE2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms