Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trem3Q9JKE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trem3Q9JKE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trem3Q9JKE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms