Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smpd3Q9JJY3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smpd3Q9JJY3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Smpd3Q9JJY3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Smpd3Q9JJY3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms