Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ascl3Q9JJR7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ascl3Q9JJR7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ascl3Q9JJR7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ascl3Q9JJR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ascl3Q9JJR7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms