Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Riox1Q9JJF3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Riox1Q9JJF3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Riox1Q9JJF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms