Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc86Q9JJ89 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc86Q9JJ89 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc86Q9JJ89 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc86Q9JJ89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc86Q9JJ89 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms