Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc22Q9JIG7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc22Q9JIG7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc22Q9JIG7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc22Q9JIG7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms