Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI91

Actn2, Alpha-actinin-2, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn2Q9JI91 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Actn2Q9JI91 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Actn2Q9JI91 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Actn2Q9JI91 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn2Q9JI91 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn2Q9JI91 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Actn2Q9JI91 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn2Q9JI91 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Actn2Q9JI91 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms