Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MkksQ9JI70 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MkksQ9JI70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MkksQ9JI70 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms