Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp29Q9ES63 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp29Q9ES63 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp29Q9ES63 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp29Q9ES63 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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