Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Trappc4Q9ES56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trappc4Q9ES56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc4Q9ES56 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc4Q9ES56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms