Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hipk3Q9ERH7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Hipk3Q9ERH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hipk3Q9ERH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hipk3Q9ERH7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms