Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubb3Q9ERD7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubb3Q9ERD7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tubb3Q9ERD7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubb3Q9ERD7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms