Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slco1c1Q9ERB5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slco1c1Q9ERB5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slco1c1Q9ERB5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slco1c1Q9ERB5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slco1c1Q9ERB5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slco1c1Q9ERB5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slco1c1Q9ERB5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slco1c1Q9ERB5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms