Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tfcp2Q9ERA0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tfcp2Q9ERA0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tfcp2Q9ERA0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tfcp2Q9ERA0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tfcp2Q9ERA0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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