Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spock2Q9ER58 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spock2Q9ER58 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spock2Q9ER58 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Spock2Q9ER58 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spock2Q9ER58 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spock2Q9ER58 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spock2Q9ER58 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms