Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tlr9Q9EQU3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tlr9Q9EQU3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tlr9Q9EQU3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tlr9Q9EQU3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms