Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
V1ra8Q9EQ48 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
V1ra8Q9EQ48 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms