Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr6Q9EPW9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr6Q9EPW9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tlr6Q9EPW9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlr6Q9EPW9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms