Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ8

Tcf20, Transcription factor 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf20Q9EPQ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcf20Q9EPQ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tcf20Q9EPQ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tcf20Q9EPQ8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tcf20Q9EPQ8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf20Q9EPQ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms