Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rpgrip1Q9EPQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Rpgrip1Q9EPQ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rpgrip1Q9EPQ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms