Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD24

Tceal9, Transcription elongation factor A protein-like 9, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal9Q9DD24 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tceal9Q9DD24 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tceal9Q9DD24 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tceal9Q9DD24 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tceal9Q9DD24 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tceal9Q9DD24 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tceal9Q9DD24 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tceal9Q9DD24 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tceal9Q9DD24 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tceal9Q9DD24 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tceal9Q9DD24 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms