Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tspan4Q9DCK3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tspan4Q9DCK3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan4Q9DCK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan4Q9DCK3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms