Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf580Q9DB38 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Znf580Q9DB38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Znf580Q9DB38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf580Q9DB38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms