Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5oQ9DB20 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp5oQ9DB20 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5oQ9DB20 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms