Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DAE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9DAE8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DAE8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DAE8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Q9DAE8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q9DAE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DAE8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Q9DAE8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DAE8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms