Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Subh2bvQ9D9Z7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Subh2bvQ9D9Z7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Subh2bvQ9D9Z7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms