Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Speer4bQ9D9F7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Speer4bQ9D9F7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Speer4bQ9D9F7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Speer4bQ9D9F7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Speer4bQ9D9F7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms