Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C6

Ccdc182, Coiled-coil domain-containing protein 182, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc182Q9D9C6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc182Q9D9C6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc182Q9D9C6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc182Q9D9C6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc182Q9D9C6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms