Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ifi35Q9D8C4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ifi35Q9D8C4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ifi35Q9D8C4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ifi35Q9D8C4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ifi35Q9D8C4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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