Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Chmp4bQ9D8B3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Chmp4bQ9D8B3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Chmp4bQ9D8B3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
Chmp4bQ9D8B3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Chmp4bQ9D8B3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Chmp4bQ9D8B3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Chmp4bQ9D8B3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,82■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Chmp4bQ9D8B3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,4 ms