Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Capn9Q9D805 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Capn9Q9D805 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Capn9Q9D805 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms