Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chmp5Q9D7S9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Chmp5Q9D7S9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chmp5Q9D7S9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chmp5Q9D7S9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chmp5Q9D7S9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Chmp5Q9D7S9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms