Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D727 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D727 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D727 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D727 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D727 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D727 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9D727 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9D727 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9D727 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D727 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D727 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D727 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D727 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D727 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D727 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D727 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D727 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D727 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D727 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D727 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D727 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D727 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D727 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D727 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D727 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D727 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D727 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D727 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q9D727 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q9D727 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D727 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D727 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D727 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D727 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D727 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D727 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q9D727 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D727 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D727 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D727 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D727 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D727 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D727 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q9D727 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D727 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Q9D727 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D727 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q9D727 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q9D727 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q9D727 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms