Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MsraQ9D6Y7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MsraQ9D6Y7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MsraQ9D6Y7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MsraQ9D6Y7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MsraQ9D6Y7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218 ms