Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4aQ9D6F9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb4aQ9D6F9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubb4aQ9D6F9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tubb4aQ9D6F9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubb4aQ9D6F9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms