Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc9bQ9D6E4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9bQ9D6E4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ttc9bQ9D6E4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms