Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cul5Q9D5V5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul5Q9D5V5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul5Q9D5V5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cul5Q9D5V5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms