Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ubxn11Q9D572 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ubxn11Q9D572 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ubxn11Q9D572 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ubxn11Q9D572 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms