Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tomm20lQ9D4V6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tomm20lQ9D4V6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tomm20lQ9D4V6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tomm20lQ9D4V6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms