Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
4931428L18RikQ9D4S9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931428L18RikQ9D4S9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4931428L18RikQ9D4S9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4931428L18RikQ9D4S9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms