Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rsph14Q9D3W1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rsph14Q9D3W1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rsph14Q9D3W1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rsph14Q9D3W1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms