Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snrnp35Q9D384 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snrnp35Q9D384 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snrnp35Q9D384 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snrnp35Q9D384 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms