Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Creb3l4Q9D2A5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Creb3l4Q9D2A5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Creb3l4Q9D2A5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms