Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc6bQ9D289 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc6bQ9D289 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trappc6bQ9D289 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms