Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpl34Q9D1R9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rpl34Q9D1R9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rpl34Q9D1R9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rpl34Q9D1R9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms