Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sec13Q9D1M0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sec13Q9D1M0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sec13Q9D1M0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sec13Q9D1M0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms